Мікробна ДНК-сигнатура розрізняє два типи раку печінки

Визначення походження пухлини — чи є вона первинною, чи метастатичною — має вирішальне значення для прогнозу перебігу захворювання та вибору стратегії лікування. Якщо джерело первинної пухлини не вдається встановити, це ускладнює діагностику та терапевтичні рішення.

Дослідники Каліфорнійського університету в Сан-Дієго виявили, що мікробна ДНК-сигнатура в плазмі крові дозволяє відрізнити первинний рак печінки від метастатичного колоректального раку. Результати опубліковані в журналі eGastroenterology.

«Використання мікробних ДНК-сигнатур може відкрити новий шлях діагностики, особливо коли методи візуалізації є неоднозначними або недоступними»,
— зазначив Амір Заррінпар, професор відділення гастроентерології та гепатології Медичної школи Каліфорнійського університету в Сан-Дієго.

З плазми крові виділили безклітинну ДНК (cfDNA) — фрагменти ДНК мертвих клітин. У дослідженні взяли участь 16 пацієнтів з первинним раком печінки та 11 пацієнтів з метастатичним колоректальним раком.

Метагеномний аналіз показав:

• мікробний класифікатор cfDNA відрізняв первинний рак печінки від метастатичного з точністю 90%;
• у пацієнтів з первинним раком печінки частіше виявлялися Pseudomonas aeruginosa, Corynebacterium accolens та C. glucuronolyticum;
• у пацієнтів з метастатичним колоректальним раком переважали Acinetobacter tandoii, A. tianfuensis, A. septicus, A. parvus, Pseudomonas asiatica та Bifidobacterium faecale;
• мікроорганізми, пов’язані з первинним раком печінки, зазвичай трапляються у пацієнтів з ослабленим імунітетом, після трансплантації печінки та при антимікробному захисті;
• мікроорганізми, характерні для метастатичного раку товстої кишки, асоціюються з лікарняними інфекціями, інфекціями кровотоку та запаленням шлунково-кишкового тракту.

Це одне з перших досліджень, що доводить можливість використання мікробної ДНК крові для неінвазивного визначення походження пухлини без застосування штучного інтелекту. Отримані дані підтверджують участь мікроорганізмів у біології пухлин.

Дослідження має клінічний потенціал: воно може сприяти ранньому виявленню раку, моніторингу пацієнтів із груп ризику та розробці нових біомаркерів на основі мікробіома для діагностики і терапії.

ДЖЕРЕЛО: Medical Xpress

На платформі Accemedin багато цікавих заходів! Аби не пропустити їх, підписуйтесь на наші сторінки! Facebook. Telegram. Viber. Instagram.