Введення геномного нагляду за патогенами як перший план готовності до майбутньої пандемії

Пандемія Covid-19 перевернула світ з ніг на голову. У боротьбі з нею однією з наших найважливіших видів зброї був геномний нагляд, заснований на секвенуванні цілого геному, який збирає всі генетичні дані певного мікроорганізму. Ця потужна технологія відстежувала поширення та еволюцію вірусу, допомагаючи скеровувати реакцію громадської охорони здоров’я та розробку вакцин і методів лікування.

Але геномне спостереження може зробити набагато більше, щоб зменшити кількість захворювань і смертей у всьому світі, ніж просто захистити нас від Covid-19. Міжнародний колектив клінічних мікробіологів і мікробіологів громадського здоров’я з Європейського товариства клінічної мікробіології та інфекційних хвороб (ESCMID) закликає до інвестицій у технології, потенціал, досвід і співпрацю, щоб поставити геномний нагляд за патогенами на передній план готовність до майбутньої пандемії.

«Інфекційні захворювання, що викликають епідемію, перетинають кордони так само швидко, як люди та торгові товари, які подорожують по всьому світу», – сказав провідний автор професор Марк Струленс з Université libre de Bruxelles, Бельгія, який раніше був головним мікробіологом Європейського центру профілактики та контролю захворювань (ECDC). «Локальний спалах сьогодні може стати наступною світовою пандемією завтра».

Важлива перевага

Більшість захворювань, які раніше не зустрічалися у людей, є зоонозами; захворювання, які зустрічаються у тварин, заражають людей. Багато хвороб у тварин також лікують антибіотиками та іншими протимікробними препаратами, які використовуються для людей. Однак широке використання протимікробних засобів у людей і тварин призвело до резистентності, оскільки мікроби еволюціонують, щоб вижити. Таким чином, ми стикаємося з двома основними загрозами громадському здоров’ю, які перетинаються: одна – від нових інфекційних захворювань, які є зоонозами, а друга – через зростання стійкості до антимікробних засобів. Боротьба з цими загрозами вимагає спільного підходу «Єдине здоров’я», який підтримується Всесвітньою організацією охорони здоров’я (ВООЗ), який визнає, що здоров’я людини залежить від здоров’я нашої екосистеми.

Відповідь, кажуть вчені, полягає в тому, щоб перепрофілювати розширену технологію геномного нагляду та можливості, створені Covid-19, щоб діяти як вартові. Геномний нагляд, який об’єднує органи охорони здоров’я, ветеринарів і лікарів, необхідно використовувати для моніторингу захворювань людей і тварин і антимікробної резистентності.

Інтегруючи епідеміологічні та клінічні дані з усіх цих областей, ми можемо отримати повну картину патогенів і ризиків, які вони становлять.

Нагляд за геномом патогенів — це інструмент, який вивчає взаємодію між антимікробним селективним тиском на популяції мікробів та адаптивною еволюцією цих мікробів до стійкості до ліків. Це дозволяє нам виявити появу та роз’єднати динаміку передачі суперпідходящих, мультирезистентних епідемічних клонів – «супербактерій». Геномний нагляд може допомогти відстежити як зоонозну, антропонозну передачу варіантів вірусу, штамів бактерій і ознак стійкості до ліків».

Професор Марк Струленс, Вільний університет Брюсселя, Бельгія

Швидке реагування

Геномне спостереження за патогенами в режимі реального часу може дозволити нам швидко виявляти нові штами резистентних бактерій і нові захворювання, що переходять між людьми й тваринами, а також відстежувати їх поширення та еволюцію.

Ця інформація може стати основою для кампаній вакцинації, допомогти розробити цілеспрямоване лікування та скерувати реакцію громадської охорони здоров’я; все це може допомогти запобігти спалаху епідемій.

Моніторинг цілих геномів також дозволить нам глибше вивчати нові хвороби та еволюцію відомих захворювань, оцінювати їх небезпеку та визначати контрзаходи. У глобалізованому світі, де збудники швидко переміщуються, геномне спостереження дало б змогу однаково швидко діагностувати та лікувати інфекції.

Струленс і його колеги підкреслюють, як нові технології секвенування, включаючи давно зчитуване секвенування геному, надшвидке секвенування та секвенування однієї клітини, а також штучний інтелект допомагають розвивати епіднагляд у деяких частинах світу.

«Є багато місць, де геномне спостереження вже забезпечує важливий захист від поширення хвороби», – сказав Струеленс. «Це включає харчові інфекції в Європі, Північній Америці та Австралії та епідемічні вірусні захворювання, такі як пташиний грип, у багатьох країнах світу».

З’єднаний світ

Щоб зробити геномний нагляд ефективним, кажуть вчені, нам потрібні доступні дані в реальному часі по всьому світу. Щоб досягти цього, нам потрібні значні інвестиції в потенціал і досвід, які враховують різні рівні інфраструктури та навчання, доступні в усьому світі. Під час пандемії Covid-19 країни, які вже мали доступ до досвіду та обладнання геномного нагляду, мали велику перевагу в моніторингу пандемії та адаптації своєї відповіді. Автори надають основу для справедливого впровадження глобально взаємопов’язаних систем спостереження, які включають країни з низьким і середнім рівнем доходу.

«Стаття Струленса та інших є обов’язковою для прочитання всім, хто цікавиться геномним наглядом як частиною готовності до епідемії», — сказав професор Маріон Купманс з Медичного центру Еразма в Роттердамі, Нідерланди, у супровідній редакційній статті. «Інструменти та амбіції є; наступним кроком є ​​створення справедливих, спільних інфраструктур спостереження для майбутнього глобального здоров’я. Запропонований ВООЗ «Договір про пандемію» буде ключовим, визначаючи деякі правила міжнародної взаємодії для кращої готовності. Цікаві часи попереду!»

Нам також терміново потрібно інвестувати у співпрацю, щоб побудувати мости між дисциплінами у галузі охорони здоров’я, а також налагодити зв’язок між країнами та агенціями охорони здоров’я. Це буде критично важливо не лише для того, щоб зацікавлені сторони могли працювати разом, але й щоб ми досягли угод щодо управління даними та регулювання, щоб дані пацієнтів були анонімними та захищеними.

«Щоб забезпечити загальну участь у спільних системах геномного нагляду в усьому світі, нашими критичними завданнями є наявність достатньої лабораторії та потужності секвенування, навчання експертної робочої сили та доступ до перевірених інструментів аналізу геномних даних і обміну в рамках комплексної безпечної цифрової інформації про здоров’я», – сказав Струеленс. «Інтеграція геномної інформації про епідемічний патоген з епідеміологічною інформацією має відбуватися в масштабі, від локального до глобального рівня».

ДЖЕРЕЛО: https://www.news-medical.net/

На платформі Accemedin багато цікавих заходів! Аби не пропустити їх, підписуйтесь на наші сторінки! Facebook. Telegram. Viber. Instagram.