Відкриття цирковірусу, пов'язаного з гепатитом людини

Незважаючи на те, що в науковій літературі регулярно повідомляють про передачу вірусів тварин людині, у Європі рідко можна виявити новий вірус у пацієнтів. Але в рамках нещодавнього дослідження вчені та лікарі ідентифікували перший цирковірус, пов’язаний із гепатитом людини.

У пацієнтки був хронічний гепатит незрозумілої природи з невеликими симптомами. 17 років тому їй пересадили серце і легені, і з тих пір її регулярно спостерігали. Ми мали доступ до великої кількості зразків протягом кількох років і тому змогли ідентифікувати цей новий вірус, що було абсолютно несподіваним,

 — пояснює Марк Елойт, останній автор дослідження, керівник лабораторії Інституту Пастера з виявлення патогенів і професор вірусології в Національній ветеринарній школі Альфорта (EnvA).

У березні 2022 року у співпраці з відділом клінічної мікробіології лікарні Necker-Enfants Malades Hospital (AP-HP) було секвеновано зразки патологічних тканин цієї 61-річної пацієнтки, яка отримувала імуносупресивну терапію, гепатит якої не мав ідентифікованої причини. Послідовності РНК (рибонуклеїнової кислоти), виділені з тканин, були проаналізовані та порівняні з послідовностями відомих збудників.

Мета полягає в тому, щоб визначити цікаві послідовності серед усіх отриманих послідовностей, що схоже на пошук голки в стозі сіна!

 — продовжує Марк Елойт. Ці тисячі послідовностей РНК аналізувалися паралельно за допомогою високопродуктивних методів секвенування mNGS (метагеномне секвенування наступного покоління) і складних алгоритмів. Після виключення загальної етіології, аналіз призвів до ідентифікації раніше невідомого виду цирковірусу, тимчасово названого людським цирковірусом 1 (HCirV-1). Жодної іншої вірусної або бактеріальної послідовності не виявлено.

Причетність HCirV-1 до гепатиту було продемонстровано шляхом аналізу зразків, взятих у пацієнтки в попередні роки в рамках її лікування після трансплантації. Результати показали, що геном вірусу HCirV-1 не виявлявся в зразках крові з 2017 по 2019 рік, а потім його концентрація досягла піку у вересні 2021 року. Була продемонстрована реплікація вірусу в клітинах печінки (від 2 до 3% клітин печінки було інфіковано), що вказує на роль HCirV-1 у пошкодженні печінки: коли вірус використовує ресурси клітини печінки для реплікації, він руйнує клітину.

Діагностика гепатиту невідомої етіології залишається серйозною проблемою, як показали випадки гострого гепатиту у дітей у Сполученому Королівстві та Ірландії у квітні минулого року та про які повідомила ВООЗ. Незважаючи на те, що деякі цирковіруси є патогенними для тварин і проти них розроблені вакцини (для свиней), це перший відомий цирковірус, який є патогенним для людини. Симптоми пацієнта залишалися легкими; вірус вдалося ідентифікувати, оскільки за нею ретельно спостерігали після комбінованої трансплантації. Походження вірусу — чи циркулює він серед людей, чи тваринного походження — ще не встановлено, а джерело інфекції (контакт, їжа тощо) залишається невідомим. Після свого відкриття вчені розробили специфічний ПЛР-тест, який тепер доступний для етіологічної діагностики гепатиту невідомого походження. Також розробляється серологічний тест.

ДЖЕРЕЛО